Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRTQ9BXP5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SRRTQ9BXP5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms