Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms