Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP1Q9BWH6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP1Q9BWH6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms