Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NDC1Q9BTX1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms