Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MYCBPQ99417 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYCBPQ99417 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms