Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARXQ96QS3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms