Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A9Q96Q91 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms