Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

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Length 622 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC17Q96LX7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC17Q96LX7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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