Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPNS2Q96L46 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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