Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHDQ96IW2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHDQ96IW2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms