Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms