Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MALSU1Q96EH3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms