Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNDC1Q96C34 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms