Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF4BQ92750 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF4BQ92750 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms