Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY2Q8WXA3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms