Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU3

SGMS2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS2Q8NHU3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms