Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLGALT1Q8NBJ5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms