Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROM2Q8N271 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms