Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms