Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT28Q7Z3Y7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms