Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRINP3Q76B58 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRINP3Q76B58 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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