Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP31Q70CQ4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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