Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP34Q70CQ2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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USP34Q70CQ2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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