Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGD6Q6ZV73 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms