Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LRRC9Q6ZRR7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRC9Q6ZRR7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms