Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC141Q6ZP82 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC141Q6ZP82 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms