Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPTE2Q6XPS3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms