Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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