Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms