Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3F3CQ6NXT2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3F3CQ6NXT2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms