Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms