Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LCN10Q6JVE6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms