Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRHL2Q6ISB3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRHL2Q6ISB3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms