Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms