Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHEQ5VZ18 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms