Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BROXQ5VW32 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BROXQ5VW32 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms