Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATAD3CQ5T2N8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATAD3CQ5T2N8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms