Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCID2Q5JVF3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms