Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITRM1Q5JRX3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms