Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF2Q5BJF6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms