Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SDK2Q58EX2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms