Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms