Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms