Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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