Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC142Q17RM4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms