Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIST3H3Q16695 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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