Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NRF1Q16656 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NRF1Q16656 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NRF1Q16656 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NRF1Q16656 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRF1Q16656 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NRF1Q16656 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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NRF1Q16656 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NRF1Q16656 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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NRF1Q16656 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NRF1Q16656 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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