Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC18A3Q16572 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC18A3Q16572 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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