Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC1Q15915 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms