Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS72Q15906 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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